李慧慧，女，1982年出生，山西省长治市人。博士、研究员、博士生导师、中共党员。2009年获北京师范大学生物数学专业博士学位，2007年至2008年在美国康奈尔大学Edward S. Buckler院士实验室从事学术研究。2009年7月加入中国农业科学院作物科学研究所工作，现任中国农业科学院国家南繁研究院副院长、大数据智能设计育种创新团队首席科学家、作物科学研究所作物基因与分子设计中心副主任。

自2005年以来一直致力于作物数量遗传学研究，围绕数量性状遗传解析方法及育种应用，开发了一系列方法和软件，在国内外多家科研和育种单位广泛应用。主要研究方向为利用人工智能等前沿信息技术，基于高通量组学数据开展复杂性状重要基因定位和生物信息学、统计基因组学和数量遗传学相关研究。致力于打造“数据-技术-算法-决策”一体化的大数据遗传育种智能设计与决策平台，创新定向设计、高效培育新品种的新兴前沿技术，提升我国种业核心竞争力。

截至目前，已在Molecular Plant, Nature Plants, Plant Biotechnology Journal, Trends in Plant Science等期刊发表第一/通讯作者47篇，其中单篇他引超过1,100次的论文3篇，单篇他引超过100次的论文13篇，总引用9,649次。研制的人工智能算法授权发明专利3项，软件著作权12项，出版中文专著2部、英文专著1部。研究成果入选2023年度海南省10大杰出农业科技成果。

获国家基金委优秀青年科学基金项目资助，获中国农学会青年科技奖，入选中国农科院“农科英才”领军人才。担任中国作物学会智慧农业专业委员会秘书长，中国生物信息学会（筹）农林信息学专业委员会常务委员，Journal of Integrative Plant Biology，Theoretical and Applied Genetics，aBIOTECH，Journal of Integrative Agriculture (JIA)，New Crops，《作物学报》和《农业生物技术学报》等国内外权威期刊编委。